Özel Eğitim Bölümü'nün amacı, özel eğitim alanında yurtiçinde ve yurtdışında kullanılabilecek kuramsal ve uygulamalı bilgi üreterek; başta Milli Eğitim Bakanlığı’na bağlı resmi okul ve kurumlar olmak üzere, ülkemiz içinde ve dışında istihdam edilebilecek yeterlilikte özele eğitim öğretmen adayları yetiştirmek ve yerel ve uluslararası düzeyde çözüm önerileri gelistirmek suretiyle özel eğitim alanının gelişimine katkıda bulunmaktır. Hacettepe Üniversitesi Eğitim Fakültesinde 2013 yılında kurulan Özel Eğitim Bölümü, lisans düzeyinde ilk ögrencilerini 2016-2017 eğitim/öğretim yılında almıştır. Özel Eğitim lisans programı dört yıldır (sekiz yarı yıl) ve eğitim dili Türkçe’dir. 

2018 yılından bu yana Özel Yetenekliler Eğitimi üzerine, 2019 yılından itibaren ise Otizm Spektrum Bozukluğu Olan Bireylerin Eğitimi yüksek lisans programı hizmet vermektedir. 2019 yılından itibaren de Özel Yetenekliler Eğitimi Doktora Programı hizmet vermeye başlamıştır.